Source: SEAMEO BIOTROP's Research Grant | 2009
Abstract:
Gen 16S ribosomal RNA telah berhasil diamplifikasi pada Scirpophaga incertulas dari Jawa Barat adalah sebesar 325 pasang basa. Eksplorasi berdasarkan gen 16S ribosomal RNA pada S. incertulas populasi di Bogor, Karawang, Indramayu dan Cirebon menunjukkan bahwa populasi dari lokasi geografi yang berbeda memperlihatkan diferensiasi genetik. Dengan demikian terdapat variasi genetik intraspesies pada pengerek batang padi kuning berdasarkan gen 16S ribosomal RNA. Penelitian ini memperoleh tiga haplotipe pada penggerek batang padi kuning dari gen 16S ribosomal RNA, yaitu haplotipe 1, 2, dan 3. Haplotipe 1 merupakan haplotipe umum yang ditemukan dibanyak sampel dari tiga daerah yang dieksplorasi. Haplotipe 2 dicirikan dengan adanya nukleotida G pada posisi nukleotida ke-154, dibandingkan A pada haplotipe umum pada posisi yang sama. Haplotipe 3 dicirikan dengan adanya delesi basa T pada posisi ke 129. Hasil penelitian ini menjadi data dasar (database) untuk penggerek batang padi di Indonesia dan merupakan publikasi data 16S ribosomal RNA Scirpophaga incertulas pertama secara internasional. haplotipe ini telah disubmit ke Genbank dengan dengan nomor akses berturut-turut untuk haplotipe 1, 2, dan 3 adalah GU191881, GU191882, GU191883.Download full report