Studi struktur komunitas ikan dan suksesi  ekologi terumbu karang di Kepulauan Seribu dilakukan di Karang Congkak, Karang Lebar, Pulau Panggang dan Pulau Pramuka pada bulan Mei 2008. Tujuan penelitian adalah mempelajari struktur komunitas ikan karang dan suksesi ekologi ekosistem terumbu karang di Kepulauan Seribu.  Pengambilan data ikan karang dilakukan dengan metode pencacahan visual masing-masing pada kedalaman 3m dan 10 m dengan menggunakan transek garis menyinggung (Line Intercept Transect), yang dimodifikasi dari English. Hasil pengamatan di semua stasion ditemukan struktur komunitas ikan karang yang terdiri dari 26 famili yang terdiri dari 108 species dan kisaran species di stasion pengamatan antara 16-27 species yang berasal dari kisaran famili antara 5-11. Suksesi ekologi berdasarkan rank-frequency diagram (Diagram Frontier) pada kedalaman 3 m cenderung menunjukkan ekosistem pada stadia maximum diversity (stadia-2), sedangkan pada kedalaman 10 m terdapat pada stadia juvenile ecosystem (stadia-1).