Source: SEAMEO BIOTROP's Research Grant | 2009
Abstract:
Gen xylanase xynA yang diisolasi dari strain lokal termofilik Geobacillus stearothermophilus yang berasal dari pantai sekitar kawah gunung, Tanjung Api, Poso Indonesia, telah berhasil dikloning. Gen xynA ini memiliki open reading frame (ORF)berukuran 1221 bp yang menyandi 407 asam amino termasuk 30 residu signal peptida. Keseluruhan sekuens asam amino menunjukkan tingkat kemiripan yang tinggi (98%) xylanase thermo-alkalistabil dari G. stearothermophilus T-6 yang digolongkan sebagai glycoside hydrolase family 10 (GH10). Fragmen gen xynA disubkloning menggunakan plasmid pET-21b dan diekspresikan pada Escherichia coli BL21 (DE3) pLys. Protein rekombinan yang diekspresikan diprediksi berukuran ±43 kDa. Sayangnya, xylanase rekombinan tidak terekspresikan dengan baik karena pET-21b relatif tidak stabil. Sebagai alternatif, penelitian pendukung menggunakan plasmid yang terbukti lebih stabil pET-32b sedang dilakukan. Ke depan, enzim rekombinan xylanase dari strain lokal ini diharapkan memiliki karakteristik thermostabil dan alkalistabil yang cocok untuk industri pulp dan kertas.
Kata kunci: Geobacillus stearothermophilus, glycoside hydrolase 10, strain lokal,
termofilik, termo-alkalisatbil, xylanase.
Download full report